Naxxar eli In-Naxxar on kaupunki Maltan saaren pohjoisosassa. Joulukuussa 2017 kaupungin väkiluvuksi arvioitiin 14 467. Vuoden 2011 väestönlaskennassa sen asukasluku oli 12 875. Sen pinta-ala on 11,6 neliökilometriä. Alueeseen kuuluvat Naxxarin keskusta, Sghajtarin alue, Santa Marija tax-Xaghra, San Pawl tat-Targa, Birguma, Maghtab, Salina, Bahar ic-Caghaq ja osa Madlienaa.
Naxxarin kirkko on omistettu Voittojen Neitsyt Marialle. Häntä juhlitaan 8. syyskuuta. Naxxarissa järjestettiin aiemmin Maltan kansainväliset messut, mutta ne siirrettiin jokin aika sitten Ta' Qaliin. Naxxarin nähtävyyksiin kuuluu Palazzo Parisio. Seudulla toimiva Maltan kuuluisin liköörin valmistaja Zeppi’s valmistaa muun muassa Bajtra-likööriä.
