Loreto ist ein Municipio des mexikanischen Bundesstaates Baja California Sur. Das Municipio hat 16.738 Einwohner (Volkszählung 2010) und eine Fläche von 4.637 km². Hauptort und größter Ort im Municipio ist das gleichnamige Loreto. Die Gemeinde wurde 1992 aus Teilen des Municipio Comondú gebildet.
Das Municipio Loreto liegt im Osten des Bundesstaates Baja California Sur auf einer Höhe von bis zu. Es zählt zur Gänze zur physiographischen Provinz der Halbinsel Niederkalifornien. Die Geologie des Municipios setzt sich zusammen aus 65 % Extrusivgestein, 25 % Sedimentgestein und 9 % Alluvionen, vorherrschende Bodentypen sind der Leptosol (56 %), Regosol (18 %) und Vertisol (11 %). 99 % der Gemeindefläche sind mit Gestrüpplandschaft bedeckt.
Das Municipio Loreto grenzt an die Municipios Mulegé und Comondú sowie an den Golf von Kalifornien. Zum Municipio gehören auch mehrere Inseln im Golf von Kalifornien, darunter Isla Carmen, Isla Coronados, Isla Monserrat und Isla Santa Cruz.
